Předmět je základní jednotka výuky, jejímž prostřednictvím si student osvojí ucelenou část souboru znalostí a dovedností, potřebnou pro zvládnutí studijního oboru/specializace. Za věcný obsah předmětu zodpovídá garant předmětu. Časovou náročnost předmětu zhruba vyjadřuje atribut předmětu rozsah kontaktní výuky. Například rozsah = 2+2 značí, že předmět bude mít týdně dvě hodiny přednášek a dvě hodiny cvičení týdně. Na závěr semestru musí vyučující provést vyhodnocení, nakolik si ten který student osvojil poznatky a dovednosti, kterých měl během výuky nabýt. Jakým způsobem toto hodnocení vyučující provedou určuje atribut způsob zakončení. U předmětu lze definovat, že předmět je zakončen pouze zápočtem(Z), klasifikovaným zápočtem(KZ), pouze zkouškou(ZK), nebo zápočtem a zkouškou(Z,ZK). Náročnost úspěšného absolvování předmětu je vyjádřena ECTS kreditními body. Výuka předmětu probíhá během semestru. Opakovaně se předmět vyučuje vždy v zimním(Z), nebo v letním(L) semestru každého akademického roku. Výjimečně může předmět být nabízen studentům v obou semestrech(Z,L). Za organizační zajištění výuky zodpovídá přiřazená katedra, která zejména vytvoří časový rozvrh předmětu a zajistí pro předmět vyučující. Někteří přednáší a zkouší, jiní vedou cvičení a udělují zápočty.
Obsahová náplň a další organizační informace, týkající se předmětu je popsána pomocí různých popisných textů(anotace, týdenní osnova, literatura, apod.)
$DODATEK_POPIS
| NIE-EVY | Efficient Text Pattern Matching | Rozsah kontaktní výuky: | 2P+1C | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Vyučující: | Holub J. | Způsob zakončení: | Z,ZK | ||
| Zodpovědná katedra: | 18101 | ECTS Kredity: | 5 | Semestr: | Z |
Anotace:
Students get knowledge of efficient algorithms for text pattern matching. They learn to use so called succinct data structures that are efficient in both access time and memory complexity. They will be able to use the knowledge in design of applications that utilize pattern matching.
Osnovy přednášek:
| 1. | Introduction, basic definitions, border array. | |
| 2. | Text full index: Suffix array. | |
| 3. | Text full index: Suffix tree, LCP construction. | |
| 4. | Text full index: Factor, suffix automata, on-line construction. | |
| 5. | Exact pattern matching algorithms. | |
| 6. | FFT in pattern matching. | |
| 7. | Succinct data structure: rank & select. | |
| 8. | Succinct data structure: wavelet tree. | |
| 9. | FM-Index. | |
| 10. | Dictionary representation, spell checking. | |
| 11. | Approximate pattern matching. | |
| 12. | (2) Pattern matching in bioinformatics. |
Osnovy cvičení:
| 1. | Basic definitions. | |
| 2. | Text full index | |
| 3. | Exact pattern matching algorithms. | |
| 4. | FFT in pattern matching. | |
| 5. | Succinct data structure | |
| 6. | FM-Index, approximate pattern matching. |
Literatura:
| 1. | Smyth, W. F. : Computing Patterns in Strings. Addison Wesley, 2003. ISBN 0201398397. | |
| 2. | Crochemore, M. - Rytter, W. : Jewels of Stringology. World Scientific Publishing Company, 2003. ISBN 9810248970. | |
| 3. | Navarro, G. - Raffinot, M. : Flexible Pattern Matching in Strings. Cambridge University Press, 2008. ISBN 0521039932. | |
| 4. | Crochemore, M. - Hancart, C. - Lecroq, T. : Algorithms on Strings. Cambridge University Press, 2007. ISBN 0521848997. |
Požadavky:
Knowledge of basic data structures, fundamentals of computer programming, and theory of finite automata.
|
|
Předmět je zahrnut do těchto studijních plánů:
| Stránka vytvořena 29. 4. 2024, semestry: Z/2023-4, Z/2019-20, L/2021-2, L/2020-1, L/2022-3, Z/2021-2, L/2019-20, Z/2022-3, Z/2020-1, L/2023-4, Z/2024-5, připomínky k informační náplni zasílejte správci studijních plánů | Návrh a realizace: J. Novák, I. Halaška |